国家土壤肥力与肥料效益监测站网主要研究对我国不同区域、不同类型土壤和不同施肥制度条件下土壤肥力长期演变规律；肥料利用率以及肥料的农学和生态环境效应；研究我国不同水热梯度带农田土壤肥力质量和环境质量演变规律，最佳施肥制度以及集约化养殖废弃物农业利用的环境效应。